Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LYSMD4Q5XG99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms