Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSTF3Q12996 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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