Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SSB2YNL209W 1842 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 KIN2YLR096W 3444 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 RPL43BYJR094W-A 279 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 YJR096WYJR096W 849 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 CTR3YLR411W 726 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 OXP1YKL215C 3861 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 ASN2YGR124W 1719 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 AKL1YBR059C 3327 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 YNL194CYNL194C 906 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 MRS2YOR334W 1413 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 IMD3YLR432W 1572 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 TOS2YGR221C 1869 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 RSC2YLR357W 2670 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 CDC12YHR107C 1224 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 Q0182Q0182 405 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 RCK2YLR248W 1833 nt6.77□□□□□ -1.32
TY1B-BRQ12193 ARG82YDR173C 1068 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 IGO2YHR132W-A 396 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 SFB3YHR098C 2790 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 FLC1YPL221W 2382 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 QCR2YPR191W 1107 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 MHF2YDL160C-A 243 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 CNB1YKL190W 528 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 YPR109WYPR109W 885 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 FRS1YLR060W 1788 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 BIT2YBR270C 1638 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 MIC26YGR235C 702 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 FMP46YKR049C 402 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 ELP2YGR200C 2367 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 SSL1YLR005W 1386 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 RVB1YDR190C 1392 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 COQ4YDR204W 1008 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 YKL223WYKL223W 333 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 GSY2YLR258W 2118 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 MCM1YMR043W 861 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 YFT2YDR319C 825 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 YEL077CYEL077C 3834 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 NCS6YGL211W 1080 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 DSS4YPR017C 432 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 EPS1YIL005W 2106 nt6.71□□□□□ -1.33
TY1B-BRQ12193 FUR1YHR128W 651 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 DPH1YIL103W 1278 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 SIA1YOR137C 1869 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 MCM5YLR274W 2328 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 RRB1YMR131C 1536 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 CWC2YDL209C 1020 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 TNA1YGR260W 1605 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 NTR2YKR022C 969 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 GCR1YPL075W 2358 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 NOG2YNR053C 1461 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 OTU1YFL044C 906 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 LSO1YJR005C-A 282 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 AIM26YKL037W 357 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 CWC25YNL245C 540 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 YDR445CYDR445C 408 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 VID27YNL212W 2349 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 YBR284WYBR284W 2394 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 MBR1YKL093W 1020 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 DAL7YIR031C 1665 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 AGA1YNR044W 2178 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 SPO19YPL130W 672 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 TDA1YMR291W 1761 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 CAF16YFL028C 870 nt6.65□□□□□ -1.34
TY1B-BRQ12193 JHD2YJR119C 2187 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 SUR2YDR297W 1050 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 RSF1YMR030W 1131 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 SYP1YCR030C 2613 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 YIL055CYIL055C 1884 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 GDB1YPR184W 4611 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 RSC58YLR033W 1509 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 LTV1YKL143W 1392 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 STE20YHL007C 2820 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 ZPR1YGR211W 1461 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 MAK3YPR051W 531 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 HEL1YKR017C 1656 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 SPC105YGL093W 2754 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 SMC5YOL034W 3282 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 MCM6YGL201C 3054 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 YCL012CYCL012C 405 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 UGA1YGR019W 1416 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 LAG2YOL025W 1983 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 AIP1YMR092C 1848 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 DAN1YJR150C 897 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 PUS5YLR165C 765 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 HMX1YLR205C 954 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 RNR3YIL066C 2610 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 SEC39YLR440C 2130 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 TIF34YMR146C 1044 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 RET3YPL010W 570 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 RSA4YCR072C 1548 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 OCA4YCR095C 1089 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 TPK1YJL164C 1194 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 PER33YLR064W 822 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1B-BRQ12193 KIN4YOR233W 2403 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YML116W-AYML116W-A 303 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 MSK1YNL073W 1731 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YMR221CYMR221C 1515 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YPL245WYPL245W 1365 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YHR173CYHR173C 339 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.5 ms