Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 ILV1YER086W 1731 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SYN8YAL014C 768 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 NTR2YKR022C 969 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 DID2YKR035W-A 615 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 ALT1YLR089C 1779 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 ECM19YLR390W 339 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 HOF1YMR032W 2010 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YNL171CYNL171C 369 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 CSL4YNL232W 879 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YAP7YOL028C 738 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SKS1YPL026C 1509 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SRB6YBR253W 366 nt7.14□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SET5YHR207C 1581 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YBR241CYBR241C 1467 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 APM3YBR288C 1452 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 DBP5YOR046C 1449 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 ALG1YBR110W 1350 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SRO9YCL037C 1305 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MDE1YJR024C 735 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 ECM31YBR176W 939 nt7.13□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YDL109CYDL109C 1944 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MTQ2YDR140W 666 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MIA40YKL195W 1212 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MRP2YPR166C 348 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 NOP2YNL061W 1857 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 AQR1YNL065W 1761 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 EDE1YBL047C 4146 nt7.12□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 UBC1YDR177W 648 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YER085CYER085C 522 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 GAB1YLR459W 1185 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YNL200CYNL200C 741 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SPS19YNL202W 879 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MVD1YNR043W 1191 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 AIF1YNR074C 1137 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 PBP2YBR233W 1242 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 PMA1YGL008C 2757 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SEC24YIL109C 2781 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 TOD6YBL054W 1578 nt7.11□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 KRE28YDR532C 1158 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YER010CYER010C 705 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YGL230CYGL230C 444 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 VMA16YHR026W 642 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 EST3YIL009C-A 546 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 CMC1YKL137W 336 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 PER33YLR064W 822 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 SPC2YML055W 537 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YNL108CYNL108C 813 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YNL285WYNL285W 372 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YPL068CYPL068C 882 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 TRM1YDR120C 1713 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 HXT4YHR092C 1731 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 BRL1YHR036W 1416 nt7.1□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 FBP26YJL155C 1359 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MAK31YCR020C-A 267 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 snR82snR82 268 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 QCR6YFR033C 444 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MDJ2YNL328C 441 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 MUM2YBR057C 1101 nt7.09□□□□□ -1.27
SUB2Q07478 YMD8YML038C 1329 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 SDT1YGL224C 843 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 DAL2YIR029W 1032 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 GTT1YIR038C 705 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 CTK2YJL006C 972 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YJR071WYJR071W 369 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 MEH1YKR007W 555 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YNR040WYNR040W 771 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 MED7YOL135C 669 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YNG1YOR064C 660 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 RPB8YOR224C 441 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 PCL8YPL219W 1479 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 SIS2YKR072C 1689 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YME1YPR024W 2244 nt7.08□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 NTE1YML059C 5040 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 DCV1YFR012W 609 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 RPP1YHR062C 882 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YLR126CYLR126C 756 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 RRG9YNL213C 645 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 CAF40YNL288W 1122 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 AIM39YOL053W 1188 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 YOR114WYOR114W 885 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 TRM13YOL125W 1431 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 RGD2YFL047W 2145 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 TYR1YBR166C 1359 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 PMT5YDL093W 2232 nt7.07□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 LDB17YDL146W 1476 nt7.06□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 CEF1YMR213W 1773 nt7.06□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 DON1YDR273W 1098 nt7.06□□□□□ -1.28
SUB2Q07478 SOL3YHR163W 750 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms