Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2C1P98194 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2C1P98194 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms