Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHC1P78364 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHC1P78364 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHC1P78364 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHC1P78364 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHC1P78364 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHC1P78364 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHC1P78364 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHC1P78364 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHC1P78364 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHC1P78364 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHC1P78364 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHC1P78364 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHC1P78364 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHC1P78364 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms