Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB2P55268 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB2P55268 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB2P55268 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms