Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSE1LP55060 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSE1LP55060 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSE1LP55060 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSE1LP55060 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSE1LP55060 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSE1LP55060 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms