Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGGT1BP53609 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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