Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UTRNP46939 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UTRNP46939 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UTRNP46939 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UTRNP46939 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UTRNP46939 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UTRNP46939 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UTRNP46939 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UTRNP46939 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UTRNP46939 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UTRNP46939 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UTRNP46939 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UTRNP46939 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UTRNP46939 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UTRNP46939 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UTRNP46939 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms