Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4A3P38919 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4A3P38919 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms