Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA4P22748 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA4P22748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA4P22748 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA4P22748 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA4P22748 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA4P22748 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA4P22748 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA4P22748 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CA4P22748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA4P22748 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CA4P22748 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA4P22748 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA4P22748 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA4P22748 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA4P22748 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CA4P22748 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA4P22748 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CA4P22748 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA4P22748 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA4P22748 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA4P22748 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA4P22748 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA4P22748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA4P22748 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CA4P22748 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CA4P22748 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA4P22748 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA4P22748 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA4P22748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CA4P22748 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA4P22748 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA4P22748 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CA4P22748 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms