Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHBP21953 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHBP21953 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHBP21953 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms