Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA1P20827 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms