Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM1P13164 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms