Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms