Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPO95166 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABARAPO95166 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPO95166 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms