Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3BO75182 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3BO75182 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms