Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFS5O43920 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFS5O43920 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms