Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCP110O43303 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCP110O43303 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCP110O43303 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCP110O43303 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCP110O43303 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCP110O43303 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCP110O43303 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCP110O43303 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCP110O43303 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms