Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARID3CA6NKF2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARID3CA6NKF2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARID3CA6NKF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms