Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP69A5D8W1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP69A5D8W1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP69A5D8W1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP69A5D8W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP69A5D8W1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms