Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMCO3A2RU48 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO3A2RU48 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMCO3A2RU48 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms