Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAXBP1Q9Y5B6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms