Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR55Q9Y2T6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR55Q9Y2T6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms