Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCTPQ9UKL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms