Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDP1Q9P0J1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms