Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms