Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSUN3Q9H649 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN3Q9H649 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms