Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDCBP2Q9H190 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDCBP2Q9H190 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms