Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GINS3Q9BRX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GINS3Q9BRX5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms