Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GORASP1Q9BQQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GORASP1Q9BQQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms