Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUFY1Q96T51 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUFY1Q96T51 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms