Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM12Q96EX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms