Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RFT1Q96AA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFT1Q96AA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFT1Q96AA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms