Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC13A3Q8WWT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3Q8WWT9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms