Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC01555Q8NAE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms