Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPARGC1BQ86YN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPARGC1BQ86YN6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms