Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHLDB3Q6NSJ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms