Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX30Q5VWJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX30Q5VWJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX30Q5VWJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms