Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC183Q5T5S1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC183Q5T5S1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms