Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME3Q16798 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME3Q16798 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME3Q16798 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ME3Q16798 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ME3Q16798 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME3Q16798 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ME3Q16798 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME3Q16798 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ME3Q16798 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME3Q16798 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME3Q16798 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME3Q16798 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME3Q16798 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME3Q16798 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME3Q16798 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME3Q16798 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ME3Q16798 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ME3Q16798 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ME3Q16798 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ME3Q16798 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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