Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18Q15532 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SS18Q15532 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SS18Q15532 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SS18Q15532 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SS18Q15532 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SS18Q15532 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SS18Q15532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SS18Q15532 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SS18Q15532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SS18Q15532 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SS18Q15532 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms