Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH18Q13634 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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