Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL6Q02878 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL6Q02878 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms