Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG1BP48304 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG1BP48304 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG1BP48304 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG1BP48304 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
REG1BP48304 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG1BP48304 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG1BP48304 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
REG1BP48304 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
REG1BP48304 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms