Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNT3P45378 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNT3P45378 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNT3P45378 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms