Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A2P43004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A2P43004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms