Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A1P19634 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A1P19634 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms