Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2CP19387 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2CP19387 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms